赛默飞液质联用的灵敏度高，通量性能好——优异的高流量性能、降低的离子抑制效应、自清洁离子源探针设计和可靠的接口设计，加速了分析速度；使用更简便。
赛默飞液质联用作为一种新型的液相色谱技术。利用待测样品中不同组分所带电荷性质、数量、组分质量不同，运用色谱技术进行分离分析。能一次性对多组份无机样品中各种阴或阳离子进行定性、定量分析，有机样品中有机酸、碱、氨基酸成份进行定性、定量分析，赛默飞离子色谱仪广泛应用于食品科学、饲科行业、无机化工、水质分析、农村土壤及植物样品分析。
分离的原理是基于离子交换树脂上可离解的离子与流动相中具有相同电荷的溶质离子之间进行的可逆交换和分析物溶质对交换剂亲和力的差别而被分离。适用于亲水性阴、阳离子的分离。
高压输液泵将流动相以稳定的流速（或压力）输送至分析体系，在色谱柱之前通过进样器将样品导入，流动相将样品带入色谱柱，在赛默飞离子色谱仪中各组分被分离，并依次随流动相流至检测器。抑制型离子色谱则在电导检测器之前增加一个抑制系统，即用另一个高压输液泵将再生液输送到抑制器。在抑制器中，流动相背景电导被降低，然后将流动出物导入电导池，检测到的信号送至数据处理系统记录、处理或保存。非抑制型离子色谱仪不用抑制器和输送再生液的高压泵，因此仪器结构相对比较简单，价格也相对比较便宜。
赛默飞液质联用提供的信息：
（1）提供分子量，确定分子式：采用同位素丰度法或高分辨质谱求算分子式。
（2）提供化合物的结构信息：根据分子离子峰及裂解碎片推断官能团、辨认化合物类型和推导骨架结构等。
（3）复杂混合物的定性定量分析：法分析挥发油的化学组成，化合物的裂解在一定的条件下遵循一定的规律，故比较试样与标准品的质谱图，可为鉴定是否为同一化合物提供依据。随着新的离子源不断出现，LC-MS法在结构研究方面发挥的作用越来越大，而且更加方便快捷。
赛默飞液质联用：静态仪器有单聚焦磁质谱、双聚焦磁质谱；动态仪器有四极杆质谱、离子阱质谱、飞行时间质谱等。
（1）四极杆质谱：体积小，质量轻，价格低，使用；扫描速度快，适合与色谱连用，定量方面有优势。但只能做到二级质谱（三重四极杆串联质谱）。
（2）离子阱质量分析器：当射频电压的zui高值逐渐增高时，质荷比从小到大的离子逐次排除并被记录而获得质谱图。离子阱质谱可以很方便地进行多级质谱定性分析，性能好，在剖析物质结构、药物代谢物研究等方面具有zui强大的功能。
（3）飞行时间质量分析器：离子质量越大，到达接收器所用时间越长，离子质量越小，到达接收器所用时间越短，根据这一原理把不同质量的离子按m/z值大小进行分离。可检测的分子量范围大，扫描速度快，仪器结构简单。
（4）高分辨质谱：生物质谱要求质量分析器的测定范围高于普通的有机质谱，多用TOF。离子源常用ESI源和MALDI源（基质辅助激光解吸电离）。
（5）静电轨道阱质谱：属于高分辨质谱。此外，分辨率即分开相邻离子的能力，分辨率越高，越能区分小的质量差。
赛默飞液质联用除了可以安捷伦液质联用所不能分析的强极性、难挥发、热不稳定性的化合物之外，还具有以下几个方面的优点：
①分析范围广，MS几乎可以检测所有的化合物，比较容易地解决了分析热不稳定化合物的难题；
②分离能力强，即使被分析混合物在色谱上没有*分离开，但通过MS的特征离子质量色谱图也能分别给出它们各自的色谱图来进行定性定量；
③定性分析结果可靠，可以同时给出每一个组分的分子量和丰富的结构信息；
④检测限低，MS具备高灵敏度，通过选择离子检测（SIM）方式，其检测能力还可以提高一个数量级以上；
⑤分析时间快，HPLC-MS使用的液相色谱柱为窄径柱，缩短了分析时间，提高了分离效果；
⑥自动化程度高，HPLC-MS具有高度的自动化。
赛默飞液质联用分析方法的建立：检查已有的色谱条件是否可以离子化、考虑用何种源、决定用正离子还是负离子、改用挥发性流动相或分离模式、优化离子源参数提高灵敏度、质谱不能检测没有离子化的物质。
